プログラミング仮想データセット配布【逆問題・不良設定問題】
概要 不良設定問題に対する機械学習を行うための、仮想データセットを作成した。 このデータセットでは、dataに３種類の（仮想の）血液検査値が与えられており、この値から、targetとして与えられた、体内に存在する８種類の（仮想の）細菌の比率...
工学
プログラミング
Python尤度と誤差の関係―ガウス誤差モデル下のAIC, BIC
概要 WikipediaのBIC（ベイズ情報量基準）のページを読んでいると、BICは $$\mathrm{BIC}=-2\cdot\ln(L)+k\ln(n)\tag{1}$$ と定義されるが、ガウス誤差の下では $$\mathrm{BIC...
RustRustでベンチマークを取るテンプレート―TとOption<T>の速度比較
この記事は Rustにおいて、とある T型とOption<T>型に対して演算を行うのではどれぐらい速度が異なるのかを調べた。結論として、差はなかった。 その際に書いたコードは、Rustでベンチマークを取りたいとき一般にテンプレートとして使え...
ndarray対象の配列の任意の１次元の長さが、任意の大きさだけ短いゼロ配列を作成する ー Rust-Ndarray例文集（第３回）
やりたいこと 前回は、対象の配列から任意の次元（軸）をまるごと落とす方法について述べた。今回は次元（軸）の数はそのままに、任意の次元の長さ（大きさ）を短くする。つまり、Shape=の配列と、対象とする次元（軸）1、短くする長さ（大きさ）3が...
ndarray対象の配列から任意の１次元を削除したゼロ配列を作成する ー Rust-Ndarray例文集（第２回）
やりたいこと 前回、対象の配列と同じ次元・大きさを持つゼロ配列を作成する方法について述べた。今回は全く同じサイズの配列ではなく、指定した次元については欠落した配列を作成する。つまり、Shape=の配列と、欠落させる次元（軸）番号 1 が与え...
PythonGeoPandasのインストールに失敗した場合の対処法（Fiona/GDALのエラー + Rtreeのインストール）
この記事は Pythonの環境によっては、pipを用いたGeoPandasのインストールに失敗するみたいです。 私は失敗しました。 というわけで、解決策を記録しておきます。 （この記事では、GeoPandasのインストール中にFiona関連...
ndarray対象の配列と同じサイズのゼロ配列を作成する ー Rust-Ndarray例文集（第１回）
やりたいこと 任意の次元・大きさの配列が与えられたときに、それと全く同じサイズのゼロ配列を作りたい。つまり、Shape=の３次元配列が与えられた際に、Shape=の３次元ゼロ配列を取得したい。 ようは、Numpyのzeros_like関数み...
ndarrayRust-Ndarray例文集
このシリーズでは、Rustのndarrayクレートを使う際に、知っておくと便利な書き方についてまとめていく。 記事一覧 対象の配列と同じサイズのゼロ配列を作成する対象の配列から任意の１次元を削除したゼロ配列を作成する対象の配列の任意の１次元...
PythonK-meansクラスタリング―任意の距離を持つデータに対する応用―
概要 空間内の点をいくつかのグループに分割することを考え、データにK-meansクラスタリングアルゴリズムを適用する。応用例として、MDSを用いて点同士の距離が任意となる場合（直線距離でなく道のりが与えられる等）の最適化手法についても考える...
プログラミング日本の県庁所在地の緯度経度を配列にしたもの
毎回作るのが面倒なので、共有しておきます。 name = [ "札幌市", "青森市", "盛岡市", "仙台市", "秋田市", "山形市", "福島市", "水戸市", "宇都宮市", "前橋市", "さいたま市", "千葉市", "新...