陽性・陰性尤度比の意味を、ベイズの定理から導出する

確率・統計
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陽性尤度比陰性尤度比は、検査の性能を評価する指標です。

検査前確率有病率)と陽性(陰性)尤度比から、検査結果が陽性(陰性)であった場合に実際に病気である確率(検査後確率)を計算することができます。

この記事では、陽性尤度比・陰性尤度比を検査後確率の計算に使える理由について、ベイズの定理から導出します

記号の意味

この記事では、以下のような記号を使用して、用語を表現します。

  • 大文字のアルファベット:事象(「病気である」など)
  • \(\lnot A\) :事象 \(A\) の否定(「病気である」→「病気でない」など)
  • \(P(A)\) :事象 \(A\) が生じる確率
  • \(P(A|B)\) :事象 (B) が生じた状態で事象 (A) が生じる条件付き確率

前提

陽性・陰性尤度比、検査前・検査後確率

陽性・陰性尤度比の定義や、検査前・検査後確率との関係については、以下の記事でくわしく説明しています。

混同行列の読み方と指標―検査の性能は感度だけじゃ測れない!
混同行列は、検査による分類結果をまとめた表です。この表を用いて感度や特異度、偽陽性/陰性率、陽性/陰性的中率、陽性/陰性尤度比などの指標を計算し、検査の性能を評価します。この記事を読むことで、混同行列の見方と書き方を知り、そこから得られる指標の特性を理解して、検査や機械学習の性能を適切に評価することができるようになります。

検査前・検査後確率を変形した検査前・検査後オッズと尤度比の間には、以下の関係があります。

$$(陽性の検査後オッズ)=(検査前オッズ)\times(陽性尤度比)$$

$$(陰性の検査後オッズ)=(検査前オッズ)\times(陰性尤度比)$$

条件付き確率・ベイズの定理

条件付き確率ベイズの定理

$$P(A|B) = \frac{P(B|A)P(A)}{P(B)}$$

については、以下の記事でくわしく解説しています。

ベイズの定理の考え方と使い方【独立性や条件付き確率から丁寧に】
「2つの事象が同時に生じる確率」を同時確率といいます。同時確率を計算する方法について、事象の独立性や条件付き確率を通して考え、最終的にベイズの定理を導きます。この記事を読むことで、ベイズの定理を効果的に利用するための方法を理解することができます。

尤度比や検査前後の確率を記号であらわす

以下のように、事象を2つ定義します。

  • \(A\) :病気である
  • \(B\) :検査陽性である

このとき、検査前後の確率オッズは次のように表現できます。

  • \((検査前確率)=P(A)\)

  • \((陽性の検査後確率)=P(A|B)\)

  • \((陰性の検査後確率)=P(A|\lnot B)\)

  • \((検査前オッズ)=\frac{P(A)}{P(\lnot A)}\)

  • \((陽性の検査後オッズ)=\frac{P(A|B)}{P(\lnot A|B)}\)

  • \((陰性の検査後オッズ)=\frac{P(A|\lnot B)}{P(\lnot A|\lnot B)}\)

また、検査の感度(病気の人を陽性と判定できる確率)と

特異度(病気でない人を陰性と判定できる確率)は次のように書けます。

  • \((感度)=P(B|A)\)
  • \((特異度)=P(\lnot B|\lnot A)\)

したがって、陽性・陰性尤度比は

  • \((陽性尤度比)=\frac{感度}{1-特異度}=\frac{P(B|A)}{1-P(\lnot B|\lnot A)}=\frac{P(B|A)}{P(B|\lnot A)}\)
  • \((陰性尤度比)=\frac{1-感度}{特異度}=\frac{1-P(B|A)}{P(\lnot B|\lnot A)}=\frac{P(\lnot B|A)}{P(\lnot B|\lnot A)}\)

と、あらわせます。

ベイズの定理から見た尤度比

陽性の検査後確率 \(P(A|B)\) とその否定 \(P(\lnot A|B)\) について、ベイズの定理より

$$P(A|B)=\frac{P(B|A)P(A)}{P(B)}$$

$$P(\lnot A|B)=\frac{P(B|\lnot A)P(\lnot A)}{P(B)}$$

が成り立ちます。

辺々を割ると、

$$\frac{P(A|B)}{P(\lnot A|B)}=\frac{P(B|A)}{P(B|\lnot A)}\frac{P(A)}{P(\lnot A)}$$

$$(陽性の検査後オッズ)=(陽性尤度比)\times(検査前確率)$$

の関係が導かれます。

同様に、陰性の検査後確率 \(P(A|\lnot B)\) とその否定 \(P(\lnot A|\lnot B)\) について、ベイズの定理より

$$P(A|\lnot B)=\frac{P(\lnot B|A)P(A)}{P(\lnot B)}$$

$$P(\lnot A|\lnot B)=\frac{P(\lnot B|\lnot A)P(\lnot A)}{P(\lnot B)}$$

が成り立ちます。

辺々を割ると、

$$\frac{P(A|\lnot B)}{P(\lnot A|\lnot B)}=\frac{P(\lnot B|A)}{P(\lnot B|\lnot A)}\frac{P(A)}{P(\lnot A)}$$

$$(陰性の検査後オッズ)=(陰性尤度比)\times(検査前確率)$$

の関係が導かれます。

以上より、尤度比の定義からスタートして、検査前後の確率やオッズとの関係を導出することができました

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